Попечительский совет является высшим коллегиальным органом управления Центра. Попечительский совет формируется Учредителем сроком на 5 лет в количестве не менее трех человек. Лица, являющиеся работниками Центра, не могут составлять более чем одну треть общего числа членов Попечительского совета.

К исключительной компетенции Попечительского совета относится принятие решений по следующим вопросам:

• изменение устава Центра;
• определение приоритетных направлений деятельности Центра, принципов формирования и использования его имущества;
• утверждение годового отчета и бухгалтерской (финансовой) отчетности Центра;
• принятие решения о создании Центром других юридических лиц, об участии Центра в других юридических лицах, о создании филиалов и об открытии представительств Центра;
• принятие решения о реорганизации (за исключением преобразования) и ликвидации Центра, о назначении ликвидационной комиссии (ликвидатора) и об утверждении ликвидационного баланса;
• утверждение аудиторской организации или индивидуального аудитора Центра.

Единоличным органом управления Центром является директор, назначаемый Учредителем сроком на 5 (пять) лет.